Если модель "расслаивается", то проблема скорее всего в неверном результате выравнивания кадров. Можем посоветовать сбросить выравнивание для одного из поднаборов, чтобы остались только корректно выровненные кадры, а потом использовать опцию Выровнять Выбранные камеры для остальных фотографий.