Здравствуйте, Александр,
Пожалуйста, попробуйте воспользоваться следующим кодом (в версии 1.4.4):
from PySide2 import QtWidgets, shiboken2
top_window = None
for w in QtWidgets.qApp.allWidgets():
if w.inherits("QMainWindow"):
ptr = shiboken2.getCppPointer(w)
top_window = shiboken2.wrapInstance(int(ptr[0]), QtWidgets.QMainWindow)
Устанавливать дополнительные модули не требуется.