Добрый день, Иван,
Возможно, по какой-то причине испортились файлы орторектифицированных изображений в структуре проекта. Можете, пожалуйста, проверить, есть ли такие файлы в суб-директории /orthomosaic/, сколько их и сколько они занимают?
Также сообщите, пожалуйста, корректно ли построился и отображается исходный ортофотоплан в окне программы?