Добрый день,
Чем меньше точек для привязки используется, тем больше шанс, что на них будут минимальные ошибки.
Если Вы не уверены в значениях введённых Z координат, можно ввести различную точность изменения для XY и Z координат. Для этого в настройках панели Привязка для точности маркеров нужно указать 0.005/1, например, это будет означать, что точность плановых координат будет 5 мм, а Z - 1 метр. По умолчанию все координаты равнозначны, то есть введённые нулевые высоты будут интерпретироваться с той же точностью.