В таком случае хотелось бы получить хотя бы небольшой фрагмент исходных данных, на которых можно воспроизвести различия в результатах между новой и старой версией. Дополнительно PDF отчёты из проектов, обработанных в разных версиях.
Если есть возможность предоставить такие данные, то пришлите, пожалуйста, ссылки для скачивания на support@agisoft.com.