Добрый день, Дмитрий,
Скорее всего особых проблем возникнуть не должно. Однако, стоит иметь в виду, что удалённая работа с PhotoScan в полном объёме не поддерживается, так что потребуется подключить стойку к рабочему месту с монитором, клавиатурой и мышью.
Из рекомендаций, советуем использовать материнскую плату с возможностью установки хотя бы одной графической карты, т.к., во-первых, это ускорит стадию построения геометрии модели, а во-вторых, поможет просматривать и редактировать многомиллионные модели в окне отображения модели.
Ещё рекомендуем воспользоваться Windows версией PhotoScan'а, т.к. с ней работает большее число пользователей, значит, и меньше потенциальных проблем. Хотя Linux версия также доступна.