Добрый день, ole2003,
1) Настройки точности должны соответсвовать точности измерительных приборов (бортовой GPS и инерциальная система для камер).
2) Уровень земли выставлять не обязательно. Это важно только лишь в случаях сильно невертикальной съёмки при наличии углов ориентации камер в панели Привязка.
3) В качестве разделителей разрядов необходимо использовать точку, иначе все значения после "запятой" будут обрезаны.
4) Обычно мы рекомендуем Высокую точность, преслекцию по центрам фотографирования, если есть данная информация (либо Общая, если информации нет), 40 000 для особых точек и 4 000 - 10 000 для связующих точек.
5) Для сельхоз полей, если не особа важна детальность поверхности, можно использовать и низкое качество плотного облака. Среднего, скорее всего, будет более, чем достаточно.
6) Помимо уже упомянутого QGIS хотелось бы упомянуть, что простейшие измерения (координаты, расстояния, площади и объём) можно выполнять на Ортомозаике и ЦМР прямо в окне PhotoScan'а.