Добрый день,
В PhotoScan могут присутствовать два вида фигур (шейпов) - 2D и 3D. Первые возникают при рисовании в режиме Орто.
Чтобы перевести их вершины в трёхмерные необходимо наличие карты высот (DEM) под каждой вершиной, если это условие выполняется, то можно использовать опцию "Обновить высоты" из контекстного меню, доступного по правому щелчку мыши в окне Орто.